Se realiza el estudio de microorganismos como hongos y bacterias presentes en el suelo, plantas, vegetales, animales y diferentes hábitats, se lo desarrolla mediante la utilización de equipos, materiales e insumos adecuados y cumpliendo estándares técnicos y de bioseguridad. El estudio de microorganismos se lleva a cabo a través del proceso de esterilización, aislamiento, purificación, observación e identificación. El laboratorio de microbiología de la Facultad Ciencias Agropecuarias y de Recursos Naturales presta su servicio para el desarrollo de las diferentes prácticas académicas y proyectos de investigación a las carreras de Agronomía, Veterinaria, Biotecnología, Agropecuaria, Programa de Maestría de Sanidad Vegetal.